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참고: 인텔 제온 E5-2697v4 CPU와 엔비디아 GP100 GPU에서 수행 하는 벤치 마크. 모든 구현은 최대 8개의 스레드를 사용하는 BEAGLE SSE 스레드 구현을 제외한 단일 CPU 스레드를 사용합니다. 데이터 세트는 Kobert 외(2017)에 사용된 샘플입니다. 우리는 임의의 응원과 Parsimonator (Stamatakis 2014)와 parsimony 나무 검색을 실행하여 나무를 생성했다. 원고는 BEAGLE API 및 라이브러리에 대해 설명합니다 http://sysbio.oxfordjournals.org/content/61/1/170. 소스에서 BEAGLE 라이브러리를 빌드하면 구성 스크립트를 실행할 때 다음과 같은 오류 메시지가 나타납니다. NBNB: 이 페이지의 정보는 비글의 버전 3을 나타냅니다. 이제 BEAGLE을 사용하여 야수를 실행할 준비가 되었습니다. BEAST를 다시 실행하고 “BEAGLE 라이브러리 사용”을 선택하지만 “사용 가능한 BEAGLE 리소스 목록 표시” 옵션은 선택하지 않습니다. 실행 하는 경우, 초기 사전 amble 텍스트의 일환으로, BEAGLE 사용 하는 어떤 리소스를 말할 것 이다: 우리는 애리조나 대학의 데릭 J. Zwickl 감사, 플로리다 주립 대학의 피터 비어리, 캔자스 대학의 마크 T. 홀더, 그리고 자연사 스웨덴 박물관의 프레드릭 Ronquist, BEAGLE의 초기 디자인에 기여; 야리프 아리도르와 아릭 나르키스, 인텔 이스라엘, 인텔 제온 파이 프로그래밍에 대한 지원; 엔비디아의 마크 버거; AMD의 그렉 스토너와 벤 샌드러; 혜성 슈퍼 컴퓨터에서 벤치 마크를 실행하기위한 샌디에고 슈퍼 컴퓨터 센터의 웨인 파이퍼; 두 익명의 검토자, 부 편집자 데이비드 포사다, 그리고 편집장 토마스 니어 는 원고에 건설적인 의견에 대한.

G.B.는 보조금 계약 C14/18/094에 따라 인턴 폰센 KU 루벤 / 내부 기금 KU 루벤의 지원을 인정합니다. […] 0.95, (4) 하디 웨인버그 밸런스 테스트가 10-6 미만인 SNPs 로시를 제거하고 (5) 성 염색체에서 SNPs 로시를 제거한다. 품질 관리에 따라, 누락된 유전자형은 BEAGLE()을 사용하여 대부되었다. 대치 후, 가장 높은 후방 확률을 가진 대말기 투여량과 마커를 전위하는 대두 투여량 사이의 평균 추정 제곱 상관(R2)은 0.9982이다. 그리고 […] http://bochet.gcc.biostat.washington.edu/beagle/1000_Genomes.phase1_release_v3/ 상대 성능 향상 (접기 속도) 구현 및 BEAGLE 라이브러리의 다양한 버전을 사용하여 도전 고도로 분할 된 뉴클레오티드 모델 분석, 및 하드웨어 자원, BEAST와 MrBayes와. 각 프로그램에 대해 가장 느린 시스템(별표로 표시)에서 네이티브 이중 정밀도 우도 계산기를 사용할 때의 총 실행 시간을 기준으로 로그 배율에 대한 배율 향상을 보고합니다. . 사용 중인 시스템의 구성과 관련된 위에서 설명한 문제 외에도 사용되는 데이터 집합 및 진화 모델의 특성은 성능에 큰 영향을 미치거나 GPU 사용을 배제할 수도 있습니다(확장성 섹션 참조). 이전에는 다양한 하드웨어 장치에서 가장 성능이 우수한 구현을 선택하기 위해 사용자가 현재 사용 가능한 리소스(예: CPU, GPU)를 분석 매개 변수 및 데이터 집합 특성과 함께 평가해야 했습니다.